Wang i in. (Wydanie 22 września) skonstruował 22-fagowy detektor peptydowy dla raka gruczołu krokowego, z 81,6-procentową czułością i 88,2-procentową specyficznością. Wcześniej skonstruowaliśmy drzewo decyzyjne do klasyfikacji raka gruczołu krokowego, stosując pięć antygenów związanych z nowotworem, z 79-procentową czułością i 86-procentową specyficznością.2 Z mniejszym panelem wskaźniki te są równoważne tym w Wang i in. i może być poprawiony przez dobór innych antygenów związanych z nowotworem.
Tylko cztery peptydy w panelu opracowane przez Wanga i wsp. zostały uzyskane z sekwencji kodujących w ramce. To, czy inne 18 peptydów są mimotopami można określić, na przykład, przez analizę panelu fagów-peptydów z innymi kontrolami, w tym surowicą od pacjentów z zaburzeniami autoimmunologicznymi i innymi chorobami. W naszym badaniu oraz w innych badaniach w panelach antygenów użyto 3 znanych antygenów związanych z nowotworem.
Niemniej jednak główny wniosek Wanga i in. – że ich panel może dostarczyć test przesiewowy na raka prostaty – jest niepewny. Charakterystyka działania testu autorów, a także naszego panelu antygenów związanych z nowotworem, nie uzasadnia przyjęcia w programie badań przesiewowych. Proporcjonalnie, zbyt wiele nowotworów zostanie pominiętych, a wysoki odsetek fałszywych alarmów będzie niepokojący. Ocena przypuszczalnych badań przesiewowych powinna obejmować obliczanie wskaźników wiarygodności, zgodnie z wcześniejszym zaleceniem.4
EM Tan, MD
James A. Koziol, Ph.D.
Scripps Research Institute, La Jolla, CA 92037
4 Referencje1. Wang X, Yu J, Sreekumar A i in. Sygnatury autoprzeciwciał w raku prostaty. N Engl J Med 2005; 353: 1224-1235
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Koziol JA, Zhang JY, Casiano CA, i in. Rekursywne partycjonowanie jako podejście do selekcji markerów immunologicznych w diagnostyce nowotworów. Clin Cancer Res 2003; 9: 5120-5126
Web of Science MedlineGoogle Scholar
3. Suzuki H, Graziano DF, McKolanis J, Finn OJ. Odpowiedzi przeciwciał zależne od limfocytów T przeciw nieprawidłowo wyrażonemu białku cykliny B1 u pacjentów z rakiem i chorobą przednowotworową. Clin Cancer Res 2005; 11: 1521-1526
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
4. Fagan TJ. Nomogram do twierdzenia Bayesa. N Engl J Med 1975; 293: 257-257
Web of Science MedlineGoogle Scholar
Wang i in. donoszą, że autoprzeciwciała przeciwko peptydom swoistym dla raka gruczołu krokowego mogą być przydatne w teście przesiewowym w kierunku raka prostaty. Jednakże ich autoprzeciwciałowe badania przesiewowe były pozytywne w przypadku raka prostaty u 30% pacjentów z gruczolakorakiem płuca. Ponadto eukariotyczny czynnik inicjacji translacji 4 gamma (eIF4G1), który był jednym z nowych biomarkerów stosowanych przez Wanga i współpracowników, ulega nadekspresji w 72 procentach przypadków gruczolakoraków płuc i nie jest specyficznym markerem raka prostaty.
Yujiro Kida, doktor medycyny
Tsurumi University, School of Dental Medicine, Yokohama 230-8501, Japonia
Wang i współpracownicy nie wyjaśnili, czy ich badania kontrolne zostały dokładnie zbadane, aby wykluczyć raka, tak aby uniknąć jakiejkolwiek reaktywności krzyżowej. Nie wspominają o tym, ile razy przetasowania ich treningów i zestawów walidacyjnych dokonano podczas analizy; co najmniej 59! +70! mogą istnieć różne kombinacje zestawu treningowego Ein-Dor i wsp. wykazali ostatecznie, że powtarzanie analizy kilku przetasowanych zestawów treningowych eliminuje wyjątkowość sygnatury molekularnej. Wykazali, że w 70 procentach takich przetasowanych zestawów treningowych istnieje więcej niż jeden podpis o równej lub lepszej zdolności przewidywania. Dlatego jeśli ten eksperyment zostanie ponownie przeanalizowany przy użyciu kilkuset przetasowanych zestawów treningowych, mogą występować wielokrotności 22 sygnatur autoprzeciwciał z taką samą dokładnością; te 22 autoprzeciwciała mogą być tylko kilkoma wieloma przeciwciałami, które są podwyższone w prostacie i innych nowotworach. Zastanawiamy się, czy jest to prawdziwy powód około 30 procentowej wykrywalności tego podpisu u pacjentów po prostatektomii, u pacjentów z opornym na hormony rakiem gruczołu krokowego, i intrygująco u osób z rakiem płuc.
Mangesh A. Thorat, MD, DNB
Rajendra A. Badwe, MD
Tata Memorial Hospital, Mumbai 400012, Indie
[email protected] com
Odniesienie1. Ein-Dor L, Kela I, Getz G, Givol D, Domany E. Wypisanie genów sygnaturowych w raku piersi: czy istnieje unikalny zestaw. Bioinformatics 2005; 21: 171-178
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
Wang i in. zaproponować nowy marker rozpoznania raka prostaty. Badano grupę peptydów w grupie pacjentów z potwierdzonym biopsją rakiem prostaty oraz w grupie mężczyzn (zdefiniowanych jako kontrole) bez historii raka prostaty. Niemniej autorzy nie dostarczają rygorystycznych dowodów na brak raka gruczołu krokowego w tak zwanej grupie kontrolnej. Aby uniknąć błędu weryfikacji, autorzy powinni dostarczyć wyniki biopsji końcowych badań w grupie kontrolnej.
Bernardo Rocco, MD
Istituto Europeo di Oncologia, 20141 Mediolan, Włochy
bernardo. [email protected] it
Dr Bob Djavan
Uniwersytet Wiedeński, 1030 Wiedeń, Austria
Ottavio de Cobelli, MD
Istituto Europeo di Oncologia, 20141 Mediolan, Włochy
Odpowiedź
Autorzy odpowiadają: W odpowiedzi na Tan i Koziol: W badaniu Koziol i wsp., 1, który różni się znacznie od naszego, siedem antygenów związanych z guzem zostało arbitralnie wybranych i zastosowanych w multipleksowym oznaczeniu immunoenzymatycznym w celu monitorowania poziomów autoprzeciwciał we krwi. pacjenci z rakiem. W naszym badaniu zidentyfikowaliśmy nowe peptydy, które są immunogenne u pacjentów z rakiem prostaty, w porównaniu z osobnikami kontrolnymi. Panel można wyciąć z 22 do 10 peptydów fagowych o równoważnej charakterystyce działania.
Testy w obu próbach miały w przybliżeniu 80 do 90 procent czułości i swoistości w wykrywaniu raka gruczołu krokowego. Algorytm rekurencyjnego podziału stosowany przez Koziol et al. cierpi z powodu ograniczenia, że opisane drzewa są niestabilne (tj. jeśli dane zostaną zakłócone przez dodanie szumu stochastycznego, wpłynie to na zmienne i punkty odcięcia wybrane dla drzew). Zgadzamy się, że oba podejścia można by poprawić poprzez włączenie dodatkowych antygenów nowotworowych i że żadna z metod nie osiągnęła jeszcze charakterystyki działania ani dodatkowej walidacji niezbędnej do przyjęcia w programach badań przesiewowych. Jeśli chodzi o wskaźnik wiarygodności, jest to odpowiednik wyniku ryzyka, który opracowaliśmy według twierdzenia Bayesa
W odpowiedzi na Kida: Ze względu na dużą częstość występowania raka gruczołu krokowego znaczna część pacjentów z gruczolakorakiem płuca, zwłaszcza w wieku 55 lat lub starszych, może z dużym prawdopodobień
[podobne: glukoza badanie cena, licówki bez szlifowania warszawa, choroba a okres ]
[przypisy: klinika kardiologii warszawa, locoid crelo, olejek melisowy ]
Comments are closed.
mononukleoza
[..] Blog oznaczyl uzycie nastepujacego fragmentu okulista wrocław[…]
Koszt w aptece bez recepty niecałe 20 zł.
[..] odnosnik do informacji w naukowej publikacji odnosnie: biegunka u niemowlaka[…]
Lekarze czesto sie wsciekaja, ze ludzie na wlasna reke dokdztalcaja sie w internecie
[..] Cytowany fragment: boldenone undecylenate[…]
Udar mozgu, czyli wylew nie jest diagnozowany w Polsce